Fisiologi Mikrobia adalah mata kuliah pilihan yang mempelajari fungsi sel mikroba secara intensif, mencakup kajian ilmu dari berbagai disiplin (biokimia dan genetika) untuk meningkatkan pemahaman sel dan keanekaragaman karakter mikrobia. Kajian ini meliputi sitokimia mikrobia, metabolisme sentral dan konservasi energi (bioenergetik), pertumbuhan dan perkembangbiakan bakteri, biogenesis molekul dan fungsinya, integrasi proses metabolik, dan ekofisiologi mikrobia.