Mata kuliah Farmakognosi fitokimia membahas aspek dasar ilmiah, adanya keterkaitan antara metabolit sekunder atau profil metabolit penanda (marker) dalam kaitannyadengan efek farmakologik/biologik produk obat bahan alam, meliputi struktur golongan metabolit dengan bioaktivitas, struktur kimia, analisis kualitatif/kuantitatif, kegunaan dalam pengobatan maupun perkembangan obat bahan alami di bidang kesehatan.